Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd44P15379 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd44P15379 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd44P15379 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd44P15379 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd44P15379 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms