Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn1P12960 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms