Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lamp1P11438 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms