Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms