Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa9P09631 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms