Protein–RNA interactions for Protein: P09174

Pde6g, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6gP09174 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pde6gP09174 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms