Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms