Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrlP06879 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrlP06879 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrlP06879 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrlP06879 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrlP06879 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrlP06879 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrlP06879 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrlP06879 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrlP06879 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrlP06879 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrlP06879 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrlP06879 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrlP06879 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrlP06879 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrlP06879 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrlP06879 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrlP06879 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrlP06879 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrlP06879 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrlP06879 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrlP06879 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrlP06879 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms