Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06320 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06320 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06320 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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