Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tgfb1P04202 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb1P04202 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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