Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-AaP01910 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-AaP01910 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms