Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01656 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01656 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01656 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01656 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01656 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01656 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01656 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01656 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01656 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms