Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01654 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01654 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01654 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01654 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01654 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01654 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01654 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01654 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01654 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms