Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01648 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01648 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01648 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01648 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01648 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01648 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01648 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01648 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01648 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01648 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01648 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01648 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01648 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01648 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01648 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01648 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01648 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01648 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01648 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01648 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01648 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01648 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01648 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01648 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01648 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01648 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01648 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01648 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01648 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01648 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01648 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01648 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01648 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01648 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01648 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01648 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01648 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01648 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01648 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01648 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01648 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01648 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01648 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms