Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ifnb1P01575 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ifnb1P01575 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ifnb1P01575 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms