Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vti1aO89116 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms