Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sp1O89090 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sp1O89090 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sp1O89090 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms