Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BlmO88700 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BlmO88700 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BlmO88700 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BlmO88700 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BlmO88700 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BlmO88700 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BlmO88700 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BlmO88700 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BlmO88700 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BlmO88700 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BlmO88700 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BlmO88700 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BlmO88700 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BlmO88700 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BlmO88700 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BlmO88700 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BlmO88700 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BlmO88700 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BlmO88700 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BlmO88700 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BlmO88700 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BlmO88700 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BlmO88700 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BlmO88700 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BlmO88700 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BlmO88700 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BlmO88700 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BlmO88700 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BlmO88700 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BlmO88700 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BlmO88700 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BlmO88700 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BlmO88700 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BlmO88700 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BlmO88700 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BlmO88700 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BlmO88700 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BlmO88700 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BlmO88700 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BlmO88700 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BlmO88700 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BlmO88700 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BlmO88700 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BlmO88700 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BlmO88700 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BlmO88700 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BlmO88700 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BlmO88700 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BlmO88700 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BlmO88700 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BlmO88700 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BlmO88700 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BlmO88700 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BlmO88700 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BlmO88700 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BlmO88700 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BlmO88700 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BlmO88700 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BlmO88700 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BlmO88700 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BlmO88700 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BlmO88700 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BlmO88700 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BlmO88700 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BlmO88700 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms