Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3bO88509 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dnmt3bO88509 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms