Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3aO88508 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3aO88508 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms