Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AurkcO88445 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AurkcO88445 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AurkcO88445 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AurkcO88445 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms