Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vti1bO88384 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms