Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms