Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Xirp1O70373 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms