Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itgb5O70309 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms