Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HcrtO55241 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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