Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Supt5hO55201 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms