Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syngr2O55101 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr2O55101 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms