Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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BckdkO55028 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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BckdkO55028 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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BckdkO55028 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdkO55028 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdkO55028 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdkO55028 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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