Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SlkO54988 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SlkO54988 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SlkO54988 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SlkO54988 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SlkO54988 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SlkO54988 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SlkO54988 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SlkO54988 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SlkO54988 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SlkO54988 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SlkO54988 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SlkO54988 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SlkO54988 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SlkO54988 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SlkO54988 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SlkO54988 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SlkO54988 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SlkO54988 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SlkO54988 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SlkO54988 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SlkO54988 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SlkO54988 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SlkO54988 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SlkO54988 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SlkO54988 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SlkO54988 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SlkO54988 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SlkO54988 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SlkO54988 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SlkO54988 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms