Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pole2O54956 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pole2O54956 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pole2O54956 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pole2O54956 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole2O54956 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms