Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk2a2O54833 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk2a2O54833 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk2a2O54833 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk2a2O54833 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk2a2O54833 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk2a2O54833 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csnk2a2O54833 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Csnk2a2O54833 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csnk2a2O54833 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csnk2a2O54833 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csnk2a2O54833 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csnk2a2O54833 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csnk2a2O54833 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a2O54833 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a2O54833 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a2O54833 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a2O54833 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a2O54833 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a2O54833 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms