Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DffbO54788 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DffbO54788 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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