Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffaO54786 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffaO54786 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffaO54786 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffaO54786 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffaO54786 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffaO54786 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffaO54786 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DffaO54786 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffaO54786 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffaO54786 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffaO54786 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffaO54786 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffaO54786 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffaO54786 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffaO54786 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffaO54786 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffaO54786 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffaO54786 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffaO54786 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffaO54786 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffaO54786 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DffaO54786 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DffaO54786 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DffaO54786 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DffaO54786 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffaO54786 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffaO54786 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffaO54786 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DffaO54786 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms