Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EdaO54693 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EdaO54693 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EdaO54693 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EdaO54693 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EdaO54693 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EdaO54693 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EdaO54693 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EdaO54693 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EdaO54693 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EdaO54693 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EdaO54693 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EdaO54693 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EdaO54693 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EdaO54693 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EdaO54693 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EdaO54693 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EdaO54693 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EdaO54693 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EdaO54693 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EdaO54693 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EdaO54693 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EdaO54693 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EdaO54693 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EdaO54693 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EdaO54693 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EdaO54693 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms