Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pik3cdO35904 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms