Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ccl25O35903 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ccl25O35903 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ccl25O35903 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl25O35903 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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