Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf9O35739 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Klf9O35739 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Klf9O35739 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms