Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnfrsf18O35714 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf18O35714 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms