Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms