Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npc1O35604 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms