Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RaxO35602 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RaxO35602 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RaxO35602 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RaxO35602 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaxO35602 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaxO35602 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RaxO35602 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaxO35602 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaxO35602 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaxO35602 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaxO35602 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaxO35602 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaxO35602 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RaxO35602 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RaxO35602 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaxO35602 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RaxO35602 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms