Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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