Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Edil3O35474 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms