Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TnxbO35452 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TnxbO35452 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms