Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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