Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xbp1O35426 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms