Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxd2O35392 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Foxd2O35392 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms