Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Cnih1O35372 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cnih1O35372 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Cnih1O35372 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms