Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms